据悉，从2005年开始，在国家和自治区有关部门的大力支持下，正式启动新疆扁吻鱼人工繁殖孵化重点科研项目，新疆水产科学研究所和阿克苏地区水利局渔政科研人员已经先后3次成功繁育出近17万尾新疆扁吻鱼幼苗，已有9万尾投放到克孜尔水库及其它水系。

据介绍，扁吻鱼属国家一级保护水生野生动物。上世纪70年代以前，扁吻鱼在塔里木河流域数量还很多，但由于过量捕捞及塔里木河水域各支流建设的一些水利设施隔断了它们的洄游通道，破坏了扁吻鱼生长的自然环境，使其数量锐减，种群难以延续。

为了抢救这一珍稀鱼种，2000年，国家投入资金200万元在阿克苏地区建立了“中国新疆扁吻鱼人工繁育基地”。该繁育基地建立以来，已经为保护大头鱼种群的繁衍发挥着极大的作用。